BIOSS
Profilmodul “Engineering meets Biology”
Design, Konstruktion, Analyse und Anwendung biologischer Systeme
Wintersemester 2016/2017
Dozierende
- PD Dr. Joachim Boldt
- Prof. Dr. Ulrich Egert
- Dr. Thorsten Falk
- Prof. Dr. Carsten Mehring
- Prof. Dr. Gerald Radziwill
- Prof. Dr. Michael Reth
- Jun.-Prof. Dr. Winfried Römer
- Prof. Dr. Wilfried Weber
Ansprechpartner zu organisatorischen Fragen:
Apl. Prof. Dr. Gerald Radziwill: gerald.radziwill@bioss.uni-freiburg.de
Prof. Dr. Wilfried Weber: wilfried.weber@biologie.uni-freiburg.de
Veranstaltungszeit:
Vorlesung: Montag 10-12 Uhr
Praktische Übung / Seminar: Donnerstag 14-18 Uhr
Veranstaltungsorte:
Siehe jeweilige Veranstaltung.
Abkürzungen:
SSR: Signalhaus, Seminarraum 00.023
SKR: Signalhaus, Kursraum 00.003
TF: Technische Fakultät, Georges-Köhler-Allee Geb. 082 Raum SR 00.028
EGT: Labor AG Egert, Technische Fakultät
ETK: Seminarraum Institut für Ethik und Geschichte der Medizin, Stefan- Meier-Strasse 26
Modulprogramm
Teil 1: Design und Konstruktion biologischer Systeme: Synthetische Biologie
Dozenten: Weber, Radziwill
Vorlesungen
Ort: SSR
17.10.2016: Einführung in die Synthetische Biologie
24.10.2016: Design und Konstruktion von optogenetischen Werkzeugen
31.10..2016: Implementierung und Analyse von optogenetischen Werkzeugen
Praktische Übungen
Ort: SKR
20.10.2016: Herstellung von Expressionskonstrukten mit „Gibson Cloning“ und Konstruktion einer Beleuchtungsapparatur
Ort: Einführung um 14:00 Uhr im SSR
27.10.2016: Analyse der Klonierung und Implementierung von optogenetischen Werkzeugen in menschlichen Zellen
03.11.2016: Auslesen der optogenetischen Werkzeuge in menschlichen Zellen vom vorherigen Übungstag
Teil 2: Visualisierung biologischer Systeme am Beispiel künstlicher Membranen
Dozent: Römer
Vorlesungen
Ort: SSR
07.11.2016: (Ein)Blick in die Zelle – Einführung in Mikroskopiertechniken
14.11.2016: Fortgeschrittene Mikroskopiertechniken
21.11.2016: Die künstliche Zelle
Praktische Übungen
Ort: SKR
10.11.2016: Immunofluoreszenz-Experiment.
17.11.2016: Konfokale Mikroskopie.
24.11.2016: Rekonstitution von zellulären Prozessen in Liposomen.
Teil 3: Analyse biologischer Systeme mittels automatischer Bildverarbeitung
Dozent: Falk
Vorlesungen
Ort: SSR
28.11.2016: Einführung in die mikroskopische Bildanalyse, Intensitätsmessungen in Raum und Zeit
05.12.2016: Bildsegmentierung, automatisches Zählen und Vermessen von Objekten im Bild
12.12.2016: Bildregistrierung (Ausrichtung), Tracking, Template Matching, aktuelle Forschung
Praktische Übungen
Ort: TF
01.12.2016: Einführung in ImageJ, Auswertung der optogenetischen Experimente aus Teil 1
08.12.2016: Segmentierung, Partikelanalyse, Colocalization, 3D Volumenrendering, Auswertung der Experimente aus Teil 2
15.12.2016: Kompensation von Drift in Zeitserien, Tracking.
Teil 4: Anwendungen biologischer Systeme in der Immunologie und Neurotechnologie
Dozenten: Mehring, Egert, Reth
Vorlesungen
Ort: SSR
09.01.2017: Elektrophysiologie neuronaler Netze und korrelierte Calcium-Dynamik, Teil 1 (Dozent: Egert)
16.01.2017: Elektrophysiologie neuronaler Netze und korrelierte Calcium-Dynamik, Teil 2 (Dozent: Egert)
23.01.2017: Gehirn-Maschine Schnittstelle - Wie aus Denken Bewegung wird (Dozent: Mehring)
30.01.2017: Synthetische biologische Systeme zur Analyse immunologischer Vorgänge (Dozent: Reth)
Praktische Übungen
Ort: EGT
12.01.2017: Ableitung von neuronaler Netzwerkaktivität
19.01.2017: Calcium Imaging in vitro
Teil 5: Ethische und sicherheitsrelevante Implikationen technischer biologischer Systeme
Dozent: Boldt
Seminare
Ort / Zeit: ETK / jeweils 14-18 Uhr
26.01.2017: Organismus und Maschine: Biotechnologische Zukunftsvisionen und ihre ethische Relevanz.
02.02.2017: Safety und Security in der synthetischen Biologie.
Zusammenfassung zeitlicher und örtlicher Ablauf:
Vorlesung: jeweils Montag 10-12Uhr
Praktische Übung / Seminar: jeweils Donnerstag 14-18 Uhr
17.10.2016: Vorlesung SSR
20.10.2016: Einführung SSR/Praktische Übung SKR
24.10.2016: Vorlesung SSR
27.10.2016 Praktische Übung SKR
31.10.2016: Vorlesung SSR
03.11.2016: Praktische Übung SKR
07.11.2016: Vorlesung SSR
10.11.2016: Praktische Übung
14.11.2016: Vorlesung SSR
17.11.2016: Praktische Übung SKR
21.11.2016: Vorlesung SSR
24.11.2016: Praktische Übung SKR
28.11.2016: Vorlesung SSR
01.12.2016: Praktische Übung TF
05.12.2016: Vorlesung SSR
08.12.2016: Praktische Übung TF
12.12.2016: Vorlesung SSR
15.12.2016: Praktische Übung TF
09.01.2017: Vorlesung SSR
12.01.2017: Praktische Übung EGT
16.01.2017: Vorlesung SSR
19.01.2017: Praktische Übung EGT
23.01.2017: Vorlesung SSR
26.01.2017: Seminar ETK
30.01.2017: Vorlesung SSR
02.02.2017: Seminar ETK